?学园都市的夜晚十分寂静，大多数人都是学生，所以到了晚上的时候，学园都市的人气就少了很多，可很多黑暗的一面也在黑夜中闪烁。
来到一个生物研究所中，这是布束砥信所在的实验室，猎犬部队虽然并非不可信任，但木原数多，美琴已经产生怀疑了，对那个男人，美琴其实一直没有怎么信任。所以没有告知任何人，这些调查都是美琴私底下完成的。
已经几乎变红的瞳孔和大半变成铂金色的发色，美琴的眼中带着一丝暴虐。
研究所的防御很严密，门口有岗哨，电子锁也是最新型的，一般人完全不能破解。可学园都市最强的电击使也是排名前几的黑客。直接出现在岗哨中，将几个保安击倒，监控已经被美琴篡改，然后直接打开电子门，美琴大摇大摆的进入了研究所。研究所内部也有一些警戒机器人，和学园都市大街上的清洁机器人同一种型号，可任何电子产品对美琴来说都是废物，美琴直接篡改了机器人的控制系统，这些机器人视美琴如空气，美琴直接来到了地图上的核心地区。
看着眼前的中央电脑，美琴没有任何犹豫，开始攻破中央电脑的主控系统。如果是学园都市的树形图设计者，美琴可能无法攻破，那是科技测电脑的巅峰之作，美琴的计算力在树形图设计者面前还不够看，但是只是个区区超级电脑而已，美琴轻易的攻破了这里的中央电脑，开始搜索资料。说道这里，树形图设计者也已经被摧毁了，不明攻击来源的光束武器从地面击毁了搭载树形图设计者的织女星I号卫星，卫星残骸被各国的航天机构回收了一部分，学园都市派出了暗部的人也在夺回这些残骸。
“搜索量产型能力者计划。”美琴找到了最初的量产型能力者计划，这和美琴的认知中没有什么差别，使用自己的基因制造克隆人，企图量产超能力者，但是制造出来的克隆人实力不足自己的1%，平均实力只有level2的水平，所以实验很快被冻结。
“绝对能力者进化计划！”美琴不关心已经被结束的计划，从布束砥信那里了解到的实验名称，美琴看到了一条绝对能力者计划的条目，将他打开，美琴心中的怒火一下子到了极点。
经过“树形图设计者”精密演算，学园都市中的七名超能力者（Level5）中只有排名第一的一方通行有机会进化为绝对能力者（Level6），但是需要250多年的一般课程训练才能进化为绝对能力者（Level6）。因为没有能使人能够活250年的方法，因此“树形图设计者”有找出了另一种方法，那就是利用实战来促进能力的增长，即准备好特定的战场，让战斗依照计划进行以掌控“实战中能力增长”的方向性。根据“树形图设计者”的演算结果，只要准备好98种战场将超电磁炮（御坂美琴）杀害98次，一方通行便可以进化为绝对能力者（Level6）。但是因为无法准备98个超电磁炮，所以实验将目标锁定在同时期进行的“量产型能力者计划”中的“妹妹们”，由于量产型的“妹妹们”具有的能力不及其素体超电磁炮的1%——也就是“Level2”的程度，因此根据“树形图设计者”的演算结果，只要准备好两万种战场及20000名“妹妹们”也可以达到相同的目的。
打开了实验进度的内容，美琴看到了数千张被称为“妹妹”的尸体照片，有的尸体被利刃切开，有的身上又被枪弹打中的。这还是比较好的，有的尸体支离破碎，似乎是被直接撕碎的，或者根本是虐杀。虽然对克隆人并没有太大的感情，可看着这些和自己相貌完全一致的“妹妹”尸体的样子，美琴眼中的红光更盛了。
制造出自己的克隆人，美琴还能勉强接受，这是很多年前自己同意并知道的，而且那次实验后，美琴就让学园都市销毁了自己的基因。但是现在，完全隐瞒自己，将自己的克隆人虐杀，而目的是让一个人成为超能力者，这种行为，只能引起此时的美琴心中无边的杀欲，更何况，看到要杀死98个自己能够进化为绝对能力者的一方通行，美琴更加的不爽了。
“一方通行，NO.1。”美琴低语的说道，“真是让人不爽啊。”
就在美琴低语的时候，身后出现了十分熟悉的电磁波动，这是同样是电击使的能力者出现在自己身后。刚刚美琴有些走神了，正常情况，一个电击使是不会这么近距离的出现在自己身后自己还没反应过来，没等美琴躲开，这里的大门就被打开了，一个和美琴长相几乎一样，穿着常盘台校服的妹妹出现在美琴的面前。
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