学园都市是面积占据东京都西部三分之一的都市，居住着230万人，其中八成以上是学生。拥有世界上最尖端的科技，一般认为领先外界约30年，但平时除了街道上的风力发电机、自动清洁机器人和空中的飞艇外，与外界没什么不同。学园都市由统括理事会全权管理。由于技术、研究多数都是高度机密事项，学园都市内的警戒体制非常严格，对人员进出有严格的限制。
学园都市一个由二十三个学区构成的巨大的教育机构的集合体，以发掘超能力而提供特殊的教育课程，通过注射药物，向脑子中插入电极来开发超能力，主要靠从外部招收学生。除了教育机构，还有面向学生研究设施，生产、商业设施，国际展示场，国际机场等等在都市内生活的所需要的生活设施都齐备
学园都市虽然与外部隔离，但是在某些特定时段会向社会公众开放。学生家长及社会人士可以在这些时段里进入学园都市进行参观，而且还有现场电视直播能力者互相战斗的场面！如大霸星祭和一端览祭。
学园都市的学生，大部分居住在学校的宿舍中，并在各个学校中接受能力开发。学园都市的学生大都借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。有各种类型不同能力，以范围和威力分为无能力者（Level0）、低能力者（Level1）、异能力者（Level2）、强能力者（Level3）、大能力者（Level4）、超能力者（Level5）、绝对能力者（Level6），实际绝对能力者只是理论上存在进化为Level6的可能，并没有哪一个角色成功进化为Level6。并每隔一定时间会进行身体检查，重新测定一次，但学生中的六成是无能力者，而学园都市中超能力者也只有七人。
学园都市内不存在警察，只有风纪委员（Jdgeent）和教师自愿参与的警备员（Anti－Skill）维护治安。
第七学区，某高中（没错，这学校就是这个名字）门口，一个刺猬头少年偷偷的探出了头，左右张望了一下似乎在寻找什么。这时，一只手拍到了他的肩膀上，“阿上，又在找哪名可爱的女孩子啊？”“太令人羡慕了，阿上身边总是不缺美丽的女孩子啊。”这名刺猬头少年满脸苦涩的转过了头，看着身后的两名损友：“土御门，蓝发耳环，我明明给你们解释过的，那个恐怖的家伙是男人啊。”“唉！”土御门感叹了一句，“阿上啊，既然这样，为什么不用你的右手打倒他呢？”上条当麻一脸不堪回首：“第一次打败他后，他直接大叫非礼，然后我就被黄泉川老师捉住了，又被小萌老师说教了3个小时啊！那家伙，一点男生的自尊都没有吗！”“是吗？”“那当然……咦——”“嚯嚯嚯嚯，上条当麻，我真是越来越想解剖你了，这次，我不会再帮你缝合伤口的，放心吧！”不知何时出现的秀吉阴森森的说道。“我放哪门子心啊！不幸啊——”上条当麻怒吼一声，转身就跑。然后，第N+1次追逐，开始了。
我的名字是上条当麻，16岁，就读于学园都市某高中1年7组，是一个不幸的人，但是，我最大的不幸于最近降临。我，被一个疯狂的男子盯上了，他疯狂的想要解剖我的右手。这也是情有可原的吧，毕竟，我的右手中寄宿着被我称为幻想杀手的能力，无论是什么超能力，这只右手都能够抹杀掉，也许，就连神迹都能抹杀也说不定。哈，我为什么不打到那个追我的人？谁让他长了一张女孩子的脸呢，除了胸部0分外，以女孩子的标准来说，他其他方面都在90分以上，打倒他的唯一结果就是被警备员捉住，这我已经试验过了。于是，我只能拼命的逃跑，就像现在这样。咦，前面那是……
跟在上条当麻后面的秀吉发现上条当麻突然改变了方向，然后前方传来清脆的声音：“啊哈，终于找到你了，这次你别想跑，快跟我决斗。”“哔哩哔哩，我这次真有事啊，不要追我。”“啥，那你以前都是在骗我了。那么更要捉住你了。”“不幸啊——”秀吉猛地加快了速度，见到了魔禁女主角（大雾）、蛙太控、目前就读于常盘台中学的NO.4超电磁炮，御坂美琴。在那一瞬间，御坂美琴似乎心有灵犀的望了过来，在对上眼的一瞬间，两人就确定了，是队友。然后，没有丝毫对话，秀吉冲入了一条小道抄近路，御坂美琴继续追赶上条当麻。
“呼、呼、呼”粗重的喘息着，上条当麻偶然回了一下头，发现秀吉已经失去了踪影，只有御坂美琴还在追赶。一股不祥的预感出现在心中，下意识的，上条当麻猛地向右一跳，然后眼角抽搐的看着自己刚才位置上出现的弹孔，“呲，打偏了。”“秀吉，你想杀了我吗！”上条当麻看着出现在自己面前的秀吉大吼。“放心吧，最多让你失去行动能力而已。”“喂喂，上条先生的财产可不够进行断腿接续啊。”“只要你让我解剖一下，这张上限1000万的支票随你填，而且我帮你支付医疗费。”上条当麻发生了明显的挣扎，“真的吗。”“不”秀吉淡漠的收回了支票，“现在已经不用了。”上条当麻愣了一下，然后一只美丽的小手搭在了他的左肩上，“果然，那种古怪的能力只存在于你的右手上啊。零距离电击。”这是上条当麻听到的最后的声音。
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